Ołtarz Jezusa Ukrzyżowanego stoi przy ścianie zakrystii katedry wawelskiej od XIV wieku. Początkowo figura Pana Jezusa i krzyż były w drewnie lipowym. Z czasem krzyż zamieniono na dębowy. Krucyfiks pozostał niezmieniony. Jedynie w XVII wieku lipowy wizerunek pozłocono, a po konserwacji w XIX wieku Pan Jezus pozostał czarny. To miejsce uważane jest w katedrze wawelskiej za najświętsze.