W miejscu, gdzie stoi obecnie, został ustawiony dopiero w XVI w., gdy zaczęto budować nową Bazylikę św. Piotra. Wcześniej obelisk stał w innym miejscu. Przy bocznej ścianie zakrystii Bazyliki św. Piotra na dziedzińcu, który nosi nazwę „Pierwszych Męczenników”. Był to teren sławnego cyrku Nerona, miejsca gdzie rozegrał się dramat.

Formuła 1 starożytności
Obelisk znalazł się w Rzymie, gdy imperium rządził szalony cesarz Kaligula. Słynął m.in. z wielkiego zamiłowania do wyścigów rydwanów, które w tym czasie wzbudzały takie emocje, jak dzisiaj pojedynki bolidów w Formule 1. W 40 r. Kaligula postanowił zbudować nowy stadion. Wybrał miejsce na obrzeżach Rzymu, położone w dolince między dwoma wzgórzami – Vaticanum i Janiculum. W pobliżu przechodziła jedna z ważniejszych dróg starożytnego Rzymu Via Kornelia, mniej więcej przez środek współczesnego Watykanu i Bazyliki św. Piotra.