Portugalczyk nie stracił wiary w zdobycie tytułu nawet po słabym meczu z Austrią, który jego ekipa zaledwie zremisowała 18 czerwca w Paryżu, czyniąc mało prawdopodobnym awans do następnej fazy turnieju. To wtedy właśnie Santos zadedykował wygranie Euro Jezusowi. Trener napisał w nim, że chce wrócić do domu, aby m.in. porozmawiać ze swoim najlepszym Przyjacielem i Jego Matką.

W jednym z wywiadów Fernardo Santos wyznał, że najbardziej lubi się modlić przed tabernakulum. "Ideałem jest modlitwa przed tabernakulum w sanktuarium maryjnym w Fatimie. Choć od dziecka miałem w zwyczaju pielgrzymowanie tam raz w roku z moimi rodzicami, to prawdziwie świadomym swej wiary katolikiem i znaczenia tego miejsca stałem się dopiero od 1994 r. Od tamtej pory zaczynam dzień modlitwą i lekturą Biblii. Najbardziej lubię czytać listy świętego Pawła" – powiedział Fernando Santos.

Portugalski selekcjoner jest w swojej ojczyźnie animatorem kursów przedmałżeńskich, które prowadzi głównie na terenie stołecznej aglomeracji. Od ponad 20 lat regularnie uczestniczy w rekolekcjach oraz spotkaniach różnych grup religijnych.